La fiscalidad de las clínicas de neurología parte de una regla clara: la asistencia sanitaria y el diagnóstico están exentos de IVA, pero otros servicios que presta el neurólogo, como informes periciales, docencia o alquiler de salas, tributan al 21 %. Separar ambos mundos en la facturación determina la deducción del IVA y la seguridad ante la AEAT.
En Mallorca estas clínicas atienden a pacientes residentes, a extranjeros con estancias largas y a derivaciones de aseguradoras. El IVA es el mismo que en el resto de España, sin IGIC, y el análisis debe hacerse operación por operación. Conviene tener en cuenta que la actividad de un neurólogo es, con frecuencia, una mezcla de asistencia, pruebas complementarias y trabajo intelectual no asistencial.
La exención de la asistencia neurológica
El artículo 20.Uno.3.º de la Ley del IVA exime las prestaciones de asistencia médica y sanitaria realizadas por profesionales titulados. Entran, con carácter general, la consulta neurológica, el seguimiento de pacientes con epilepsia, cefaleas, enfermedades neurodegenerativas o patologías vasculares cerebrales, y las pruebas diagnósticas asociadas, como el electroencefalograma o el electromiograma, cuando se prestan con fin diagnóstico o terapéutico.
La exención es objetiva: depende de la naturaleza del servicio y no de la forma jurídica de quien lo presta. Que la actividad se desarrolle como autónomo o a través de una sociedad no cambia su calificación. Sí es relevante que los profesionales cuenten con la titulación exigida y que el acto quede reflejado en la historia clínica con motivo, exploración, diagnóstico y plan.
Servicios que no son asistencia y tributan al 21 %
Algunos ingresos de una consulta neurológica no se consideran asistencia sanitaria en sentido estricto. Es el caso, habitualmente, de los informes periciales emitidos para terceros, de la actividad docente, de las ponencias remuneradas, de los ensayos clínicos contratados por un promotor o de la cesión de salas y equipos a otros profesionales. Cada uno de estos conceptos debe analizarse individualmente, porque la exención no se contagia a toda la actividad del profesional.
La consecuencia práctica es que una misma persona puede emitir facturas exentas y facturas con IVA al 21 % en el mismo mes. Contar con series o conceptos diferenciados en el programa de facturación facilita el control y evita errores de calificación al presentar el modelo 303.
Facturación a aseguradoras y mutuas
Cuando el paciente está cubierto por una aseguradora o una mutua, la asistencia sigue siendo asistencia, aunque pague un tercero. La factura emitida a la compañía por la atención prestada mantiene su carácter exento. En cambio, si la misma factura mezcla asistencia con informes, certificados o suministros, conviene detallar cada concepto por separado, porque el tratamiento puede diferir.
También es recomendable revisar los convenios: tarifas, condiciones de liquidación, descuentos retroactivos y regularizaciones periódicas. Un abono posterior de la aseguradora puede exigir factura rectificativa y reflejo en la contabilidad del periodo correcto.
Prorrata: cuánto IVA puede deducir la clínica
La clínica que combina operaciones exentas y gravadas está sometida a la regla de prorrata. El IVA soportado en gastos comunes (local, suministros, administración, software de gestión) solo se deduce en el porcentaje que resulte de dividir el volumen de operaciones con derecho a deducción entre el total. La inversión en equipos de alto valor se ve especialmente afectada.
El artículo 9.1.c) de la Ley del IVA permite, cuando se cumplen sus requisitos, tratar como sectores diferenciados actividades que tengan regímenes de deducción distintos, con contabilidad separada y una diferencia relevante entre porcentajes. En neurología, esta vía suele plantearse si la parte gravada (periciales, formación, alquileres) alcanza un peso importante. Hay que simularla antes de solicitarla, porque su aplicación añade obligaciones formales.
Equipos de diagnóstico y amortización
Un electroencefalógrafo, un equipo de neurofisiología, un sistema de estimulación o un software de neuroimagen suponen inversiones elevadas. A efectos del Impuesto sobre Sociedades, la tabla del artículo 12 de la Ley del Impuesto sobre Sociedades fija para el instrumental médico un coeficiente lineal máximo del 15 % y un periodo máximo de 14 años. La amortización contable debe responder a la vida útil real y quedar documentada con facturas, actas de entrega y mantenimiento.
En el momento de la compra conviene decidir si se adquiere, se alquila o se utiliza mediante leasing. La elección afecta al flujo de caja, al IVA soportado y a la deducibilidad de los gastos financieros. No hay una opción mejor en abstracto; depende de la utilización prevista y de la capacidad de generar ingresos con el equipo.
Socios, sociedades y retribución del profesional
Muchos neurólogos ejercen a través de una sociedad profesional o de una sociedad de la que son socios. Las operaciones entre la sociedad y sus socios deben realizarse a valor de mercado según el artículo 18 de la Ley del Impuesto sobre Sociedades, y existe vinculación, entre otros supuestos, cuando el socio participa al menos en el 25 % del capital. Esto afecta a alquileres de consulta, préstamos, cesiones de uso de equipos y retribuciones por servicios.
La retribución debe ser coherente con la función desempeñada y con lo que se pagaría a un tercero. El sueldo del administrador, si lo hay, requiere cobertura estatutaria; el reparto entre sueldo y dividendos tiene efectos fiscales y de Seguridad Social que conviene proyectar con cifras antes de fijarlo.
Cobros, documentación y comprobaciones
Desde el punto de vista del control, hay varios puntos recurrentes en cualquier consulta médica privada: facturación correlativa, justificación de la exención con historia clínica y prescripciones, y límite de 1.000 euros en pagos en efectivo entre empresarios y profesionales. Si el paciente es un particular, el análisis del efectivo no es idéntico, pero la trazabilidad de los cobros sigue siendo una exigencia práctica de control interno.
En materia de plazos, la Ley General Tributaria sitúa la duración general de las actuaciones inspectoras en 18 meses, ampliable a 27 en los supuestos previstos. Conocer esa calendarización ayuda a gestionar los requerimientos y a organizar la prueba. Si el conflicto se centra en la calificación de los ingresos o en la valoración de operaciones con socios, un informe pericial tributario puede reforzar la posición del contribuyente con un análisis técnico independiente.
Cómo documentar la exención en la práctica
Una clínica puede protegerse con medidas sencillas: conservar historias clínicas, informes firmados y volantes de derivación; mantener un catálogo de servicios con su tratamiento fiscal; y revisar periódicamente las facturas rectificativas. El análisis general del sector está recogido en nuestra guía sobre la fiscalidad de clínicas de neurología. Para una visión complementaria del IVA sanitario en las islas, puede consultar también el artículo sobre servicios sanitarios y estéticos en Mallorca.
Preguntas frecuentes sobre clínicas de neurología
Sí. La asistencia médica y el diagnóstico prestados por profesionales sanitarios están exentos conforme al artículo 20.Uno.3.º de la Ley del IVA, aunque los pague una aseguradora. La exención se refiere a la asistencia, no a otros servicios que pueda prestar el médico.
Con carácter general sí, porque un informe emitido para un tercero o un proceso no es asistencia sanitaria. Lo mismo ocurre con la docencia o el alquiler de salas. Deben facturarse con IVA y separarse de los actos asistenciales exentos.
Si la clínica realiza operaciones exentas, el IVA soportado en la adquisición de equipos solo se deduce en el porcentaje de prorrata aplicable. En inversiones elevadas, la diferencia es relevante y justifica analizar con antelación la prorrata o los sectores diferenciados.
Historias clínicas, informes firmados, volantes de derivación, contratos con aseguradoras y facturas desglosadas. Son la prueba principal de que el servicio facturado como exento es realmente asistencia sanitaria. Conviene conservarla durante el plazo de prescripción.
Si su clínica de neurología en Mallorca necesita revisar la facturación, la prorrata o la estructura societaria, puede escribir a Contacto@LRB.es o llamar al +34 684 234 831.
Por Luis Miguel Larriba, Socio Director de LRB Tax & Legal. Contenido informativo.